新生儿黄疸换血治疗后主要副作用有感染、心力衰竭等。感染主要是由于操作、消毒等不严格，发生感染，严重可能导致败血症；也有可能感染病毒，如乙型肝炎、艾滋病等；心力衰竭主要是由于输血量过多导致心力负担加重引起的。新生儿黄疸换血治疗，主要是针对新生儿溶血性黄疸，经药物治疗、蓝光照射治疗等无效，而且病情严重的，可以考虑换血治疗。这种治疗方法一定要去大一点的正规公立医院进行。