肛门疼痛多是因为疾病引起的。临床常见的主要有1.肛门疾病，如痔疮嵌顿、肛裂、肛瘘、外痔伴感染等。2.肛门直肠周围组织感染，如肛周脓肿、肛窦炎、肛乳头炎等。3.精神因素，如肛门直肠神经官能症、坐骨神经痛等。4.直肠肿瘤，如直肠癌等。5.异物及刺激，如直肠内异物、过食辛辣刺激性食物等。另外还可见于便秘、腹泻等引起的机械性刺激。建议到肛肠科就诊，行直肠镜检查可明确诊断。