地方性克汀病的病因是胚胎期和新生儿期严重缺碘导致的结果。除缺碘学说外，还有人提出遗传问题，自身免疫问题和致甲状腺肿问题。方性甲状腺肿和地克病流行于缺碘严重地区，也应该是甲状腺激素合成不足和碘离子缺乏的直接独立作用。

地方性克汀病又称地方性呆小病，多出现在严重的地方性甲状腺肿流行地区，这是胚胎时期和出生后早期碘缺乏与甲状腺功能低下所造成的大脑与中枢神经系统发育分化障碍结果。随着碘化食盐消灭地方性甲状腺肿，地方性克汀病亦随之消灭。