常见的肛肠疾病也是肛管和直肠炎症病理过程的急性期，肛瘘是慢性期。常见致病菌包括大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、链球菌和绿脓杆菌，偶尔厌氧菌和结核分枝杆菌，经常混合感染多种细菌，最近发现与肛管损伤有关。明确诊断以后，建议尽早手术治疗，选择一次性根治手术，门诊即可进行，术后可以正常活动，无需住院。