睾丸囊肿和睾丸炎的区别主要有两个。它们的病因不同，睾丸囊肿主要是睾丸组织充血造成的，会引起睾丸肿胀、疼痛等，睾丸炎大多是细菌、病毒感染造成的，有些是外伤造成的，会引起睾丸胀痛。