治疗肠道菌群失调的药包括双歧杆菌、枯草杆菌、地衣芽孢杆菌、乳酸杆菌等。健康人胃肠道内寄居着种类繁多的微生物，称为肠道菌群，肠道菌群按一定比例组合，各菌间互相制约，互相依存，在质与量上形成生态平衡。当机体内外环境发生变化，尤其是长期使用广谱抗生素后敏感肠菌被抑制，未被抑制的细菌大量繁殖引起菌群失调，其正常生理组合被破坏产生病理性组合，引起临床症状即称为肠道菌群失调症。