秋季腹泻是由轮状病毒感染引起的。轮状病毒经过粪口途径进行传播，粪便中带有大量病毒，在擦拭粪便过程中患者手上沾有病毒。健康人直接触摸患者沾有病毒的手，或接触携带有病毒的物品，即被轮状病毒感染，引发秋季轮状病毒性的肠炎，即秋季腹泻。病毒进入体内后，在乳糖酶作用下损伤肠道细胞，影响肠道正常消化功能，使机体无法消化乳糖等糖类，临床出现恶心、呕吐、腹泻等。