引发晚上头疼的疾病很多，比如偏头痛、紧张性头痛、丛集性疼痛、颅内肿瘤、蛛网膜囊肿等。经常熬夜、不规律作息、内分泌紊乱、吸烟饮酒、经常服用止痛药物等多种因素也可以诱发头痛的发生。患者需去医院神经内科就诊，做一下头颅MRI和MRA检查看有无颅内器质性疾病存在，然后再根据检查结果指导后续药物治疗。