巧克力囊肿属于卵巢囊肿的一种，属于良性肿瘤，一般没有恶变的情况，频繁腹痛不排除囊肿破裂或者扭转的情况，具体存留时间不是最重要的。治疗才最重要。建议去医院做彩超检查，可以服用药物保守治疗缓解疼痛，必要的话需要手术切除才能治愈。